重庆市精神病院设有综合门诊部、内科、外科、失眠科、心理咨询与治疗、心理危机干预中心、精神科住院病区等临床科室。并拥有照光机、彩色脑电地形图机、心电图机、B超、化验等先进的医疗设备。开展了对各类急、慢性精神病、神经症、心理障碍患者的医疗救治、健康体检、早期心理危机干预、精神评残鉴定、卫生知识普及宣传和教育等多项工作。

      住院部内设五个病区，分别为精神一科、精神二科、精神三科、女性精神病人治疗和康复中心、老年精神科。既有基础理论扎实、技术精湛的中年专家，还有成长起来的跨世纪青年专家学者群，形成的人才梯队优势处于领先水平。住院部内设有特护病房，病房实行三级医师负责制和整体护理模式，专家定期巡回查房会诊，疑难危重病例讨论。综合运用西医药物、心理治疗、物理治疗等国内外先进诊疗技术，治疗各种症状的精神疾病。
 

      心理危机干预中心是重庆市第一家以心理危机干预为主的专业性心理咨询与治疗机构。由曾在北京心理危机研究与干预中心深造、有着上千例各类心理疾病的咨询与治疗经验的专家领衔。中心成立了专门用于心理危机和自杀的强制性心理疗养室、半开放式心理疗养室和开放式心理疗养室。设有心理CT室、心理治疗室、心理危机干预室、精神疾病诊断室、无抽搐电休克治疗室、躯体创伤治疗室、心理疗养室、手术室和急诊抢救室。

      综合门诊部有一支技术过硬、业务素质高、关心体贴病人的医护队伍。开展了精神科专家门诊、常见内科门诊。还开展了各类普外科手术，包括外伤的急救处理，阑尾炎、疝气、胆结石等常见疾病的诊疗。